食管癌组织ARL5B表达与临床病理特征的关系及作用机制
关键词:食管癌; ADP-核糖基化样因子5B(ARL5B); 临床病理学特征; Kaplan-Meier法; 生物信息学分析;
作者:赵小涵 盖春月 王鹤松 王多 檀碧波 沈文斌
1. 河北医科大学第四医院放三科2. 河北医科大学第四医院胸外科3. 河北师范大学生命科学学院4. 河北医科大学第四医院外三科0QC欢迎在线投稿
摘要:摘要:目的应用生物信息学技术探讨ARL5B的临床意义及可能的潜在作用机制,并通过临床资料、基础实验等方面进行了初步验证。方法从TCGA数据库下载食管癌数据集,R软件分析差异表达的mRNA,结合患者的临床数据集进行生存分析。取临床食管癌及癌旁组织标本,采用实时定量PCR(qRT-PCR)及蛋白印迹(Westernblotting)验证ARL5B表达。免疫组化检测ARL5B表达并评价其与食管癌患者临床病理特征的关系。利用生物信息学对ARL5B潜在作用机制初步分析,qRT-PCR初步验证可能与其作用的基因。结果 生物信息学结果显示ARL5B在人食管癌组织中的表达明显高于癌旁组织且ARL5B高表达是食管癌患者预后差的标志。淋巴结组织、肿瘤组织、癌旁组织中,ARL5B的mRNA和蛋白的表达由高到低,与生物信息学结果符合。临床分析表明ARL5B表达与肿瘤的淋巴结转移、临床分期有关,其高表达是患者预后差的标志。富集分析显示ARL5B在囊泡传输、内体传输、细胞器定位等生物学过程有关。蛋白质-蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)分析提示与ARL5B互作的蛋白质有...更多0QC欢迎在线投稿
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关键词:食管癌; ADP-核糖基化样因子5B(ARL5B); 临床病理学特征; Kaplan-Meier法; 生物信息学分析;0QC欢迎在线投稿
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基金资助:河北省科技厅卫生健康创新专项资助项目(No.21377785D);0QC欢迎在线投稿
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专辑:医药卫生科技0QC欢迎在线投稿
专题:肿瘤学0QC欢迎在线投稿
分类号:R735.10QC欢迎在线投稿